İlk yarıyı namağlup kapatan Beşiktaş, 2. yarıda oynadığı 17 maçta tam 8 kez sahadan yenik ayrılıp, 4 kez de eşitliği bozamayınca, sadece 5 kez 3 puan alıp, toplam 32 puan yitirdi. Ligin 2. yarısında toplam 23 gol atıp, kalesinde 30 gol gören Beşiktaş, ligi şampiyon Fenerbahçe'nin 14, ikinci sıradaki Trabzonspor'un da 10 puan gerisinde 3. sırada tamamlayabildi. Siyah-beyazlılar sezonun son 6 maçında galip gelemezken, son 4'ünü yitirdi, son 3'ünde gol dahi atamadı.
2003-2004 sezonunun 2. yarısında siyah-beyazlı takımın yaptığı maçlarda aldığı sonuçlar şöyle:
Beşiktaş - Samsunspor........: 0 - 4 (Hükmen).
Bursaspor - Beşiktaş.........: 0 - 1.
Ankaragücü - Beşiktaş........: 1 - 1.
Beşiktaş - Denizlispor.......: 3 - 1.
Malatyaspor - Beşiktaş.......: 0 - 0.
Beşiktaş - İstanbulspor......: 1 - 2 (İzmit'te oynandı).
Trabzonspor - Beşiktaş.......: 3 - 0.
Beşiktaş - Elazığspor........: 5 - 3.
Diyarbakırspor - Beşiktaş....: 3 - 1.
Beşiktaş - Gaziantepspor.....: 4 - 1.
Galatasaray - Beşiktaş.......: 1 - 2.
Beşiktaş - Gençlerbirliği....: 2 - 2.
Konyaspor - Beşiktaş.........: 2 - 2.
Beşiktaş - Fenerbahçe........: 1 - 3.
Adanaspor - Beşiktaş.........: 1 - 0.
Beşiktaş - Akçaabat Sebatspor: 0 - 2.
Çaykur Rizespor - Beşiktaş...: 1 - 0.